牙周病治療依據病情嚴重程度，通常分為三個主要階段：洗牙、深層刮除與牙周手術。洗牙是最基礎且常見的治療方式，適用於牙齦發炎或輕度牙周病患者。藉由超音波震動器及手動器械，清除牙齒表面及牙齦邊緣的牙菌斑與牙結石，減少細菌數量，減輕牙齦紅腫與出血現象，有助於恢復牙齦健康。
當牙周病進展至中度階段，牙周袋變深且牙結石深入牙齦下方時，需進行深層刮除。此方法能有效去除牙齦下方的牙結石和受感染的牙根表面，使牙齦能重新附著於牙齒，防止病情惡化。深層刮除可減少牙周袋深度及炎症，適合牙周袋深度約4至6毫米的患者。
嚴重牙周病患者則需接受牙周手術，尤其當牙周袋深度超過6毫米，並伴隨牙槽骨破壞時。牙周手術通常採用翻瓣術，將牙齦掀開以直接清除深層感染與病變組織，同時促進骨組織的再生。手術能改善牙齦與牙齒的結合，降低牙齒鬆動的風險，並恢復咀嚼功能。
整體來說，牙周病治療透過不同階段的介入，根據病情調整方式，達到控制感染和修復牙周組織的目標。
牙周病的治療依病情嚴重度分為不同階段。首先是基礎洗牙，這是牙周病初期或輕度患者最常見的治療方式。基礎洗牙利用超音波及手工器械清除牙齒表面及牙齦邊緣的牙菌斑和牙結石，目的是減少牙齦發炎，恢復健康的牙周環境。這階段的治療對於預防牙周病惡化非常重要，並且通常不會引起明顯不適。
當牙周囊袋深度增加，且牙結石及菌斑侵入牙齦下方時，醫師會進行深層牙周刮除。此治療多在局部麻醉下進行，使用特殊刮除器械去除牙根表面的牙結石與發炎組織，並將牙根表面磨平，促使牙齦能重新附著，防止細菌再度滋生。深層刮除的過程可能分為多次完成，以降低病患不適並讓牙周組織有時間恢復。
若病情進一步惡化，伴隨骨質流失，則需要進一步採用牙周手術。手術會翻開牙齦，清除深層感染組織，並搭配骨再生技術，改善牙齦與骨骼支持。每階段的治療方法均依照病情做適當調整，讓牙周組織恢復健康並穩定維持。
完成牙周病治療後，許多人誤以為問題已解決，實則牙齦仍處於修復與重建階段，此時的護理與追蹤反而更為重要。每天的刷牙不再只是例行公事，而是維持牙齦穩定的關鍵行為。建議使用軟毛牙刷與小頭設計，搭配正確刷牙方式，將刷毛對準牙齒與牙齦交界，輕輕畫圓或短距離水平移動，才能有效清除菌斑又不刺激牙齦。
牙線與牙間刷應列入每日清潔程序。牙周病治療後的牙齒常有間隙變大，單靠牙刷難以清除牙縫殘渣，這些工具可深入縫隙，防止牙菌斑再度堆積。若有固定假牙或牙橋，更應使用特殊清潔工具，如牙間刷或牙線穿引器。
追蹤檢查方面，應依據個人病況與醫師建議安排，常見為每三到六個月回診一次，讓牙醫確認牙齦是否持續穩定，牙周囊袋是否復發，並進行專業洗牙或深層清潔。長期使用含氟漱口水或抗菌漱口液，也能協助降低菌落形成，增加牙齦對抗發炎的能力。養成這些習慣，才是治療之後真正的起點。
牙周病初期的治療通常不需要動手術，主要透過牙根整平與抗生素療法來控制感染與炎症。牙根整平是利用專業器械去除牙根表面的牙結石和菌斑，同時將粗糙的牙根表面磨平。這樣可以減少細菌附著的環境，讓牙齦組織能更緊密地貼合牙根，降低牙周袋的深度，有助於阻止牙周組織進一步破壞。牙根整平適用於牙周袋深度約3至5毫米且骨質損失不嚴重的患者，是牙周病初期常見且重要的治療方式。
抗生素療法則是透過口服或局部給藥的方式，直接針對牙周病的致病菌進行抑制。局部抗生素如凝膠或藥物微粒可以注入牙周袋內，集中作用於病灶，減少全身性副作用。而口服抗生素多用於感染範圍較大或免疫功能較弱的患者，但必須由牙醫判斷並控制使用，以避免產生抗藥性。抗生素能有效降低牙周病菌量，控制炎症，促進牙齦組織修復。
在牙周病初期，這兩種非手術療法配合良好的口腔衛生習慣，能有效改善牙齦健康並減少疾病惡化的風險。
牙周病的發生與飲食習慣息息相關。過量攝取含糖食物會提供細菌繁殖的養分，導致牙菌斑快速堆積，使牙齦發炎加重，影響治療效果。酸性食物和飲料，如柑橘類水果、碳酸飲料，會腐蝕牙齒表面並刺激牙齦，造成組織脆弱，增加牙周病的風險。在治療過程中，控制飲食是非常關鍵的一環。
治療期間應避免食用過硬、過黏的食物，例如堅果、糖果及口香糖，這些食物容易殘留在牙縫中，成為細菌溫床，延緩牙齦恢復。辛辣或刺激性強的食物也應減少攝取，以免刺激發炎的牙齦組織。相反地，富含維生素C和鈣質的食物，如新鮮蔬果、牛奶及魚類，能促進牙齦組織修復與骨骼健康，有助於牙周病的治療進程。
除了飲食調整，養成規律且健康的生活習慣也很重要。良好的睡眠有助於提升免疫力，減少體內炎症反應，促進牙周組織癒合。戒菸是治療成功的關鍵，因為菸草會抑制血液循環，降低組織修復能力，增加感染機率。定期刷牙、使用牙線清潔牙縫，以及定期回診追蹤，都是保持牙周健康不可忽視的步驟。
每日刷牙時若經常發現牙齦滲血，或發現牙齦顏色由健康的粉紅色轉為暗紅腫脹，這些往往並非單純清潔不當，而是牙周病初期的常見表現。牙菌斑中的細菌會釋放毒素刺激牙齦，導致局部發炎，若這段時間未積極清潔與治療，發炎將從牙齦擴散至更深層的牙周組織。口腔內若開始出現莫名異味，即使使用漱口水也難以持久改善，通常代表細菌與食物殘渣已積聚於牙周囊袋內。這些區域是細菌滋生的溫床，無法僅靠日常刷牙清除。當病程進一步進展，齒槽骨會逐步流失，牙齒支撐減弱，產生咀嚼時晃動感，甚至在吃較硬食物時感覺牙齒「不穩」。這些症狀都不該輕忽，特別是當牙齒搖晃與牙齦退縮同時出現時，可能已屬中度以上牙周病變。只要察覺上述任一警訊，就應儘早至牙科診所進行牙周評估。牙醫師會透過探針測量牙周囊袋深度，搭配X光檢查齒槽骨狀況，進行分層治療，避免失去牙齒的風險。
當牙周病發展至深層牙周囊袋且保守療法無效時，牙醫師可能會建議進行牙齦翻瓣術。此手術將牙齦切開並掀起，以清除深層的牙結石與發炎組織，並直接視覺檢查骨頭損害情況。翻瓣術適用於牙周囊袋探診深度超過5毫米且非手術療法未能改善者。若患者口腔衛生不佳或有系統性疾病如糖尿病未控制，手術風險將顯著上升，包含傷口癒合延遲、感染或牙齒動搖加劇等。
骨整形成術則是在翻瓣術基礎上進行，針對因牙周病導致不規則或垂直型齒槽骨缺損進行修整或再建。這類手術可使用人工骨或再生膜輔助骨組織生長。適應對象包括有明顯骨吸收且欲保留患牙的病人。需特別考量患者的整體健康狀況、吸菸習慣與口腔清潔配合度。其風險可能包含補骨材料排斥、局部感染或再發性牙周炎。對於長期穩定成效，術後定期追蹤與維持治療是必不可少的臨床安排。